Posljednje četiri epizode Ratova klonova odvijaju se u isto vrijeme kada i Osveta Sitha, posljednji film trilogije prequel Ratova zvijezda. Ovo uključuje Red 66 i pad Jedi reda.
Nepoznati aspekt Ratova zvijezda bio je kako je omiljena obožavateljica Ahsoka Tano preživjela Red 66. Zadnje dvije epizode serije pokazuju kako je Ahsoka pobjegla.
Shattered
U devetoj i desetoj epizodi sezone, Darth Maul je postavio zamku s namjerom da ubije Anakina Skywalkera prije nego što ga Darth Sidious može okrenuti na mračnu stranu. Međutim, Anakin je bio zauzet spašavanjem kancelara Palpatina od generala Grivusa kao što je prikazano u uvodnoj sekvenci Osvete Sitha. Ahsoka se umjesto toga suočila s Maulom. Deseta epizoda završava Maulovim hvatanjem.
Serijalni šou trkač Dave Filoni rekao je za Entertainment Weekly: "Nešto što sam dugo želio da uradim je da kraj Ratova klonova bude ova priča koja se poklapa sa nekim od ovih ljudi koji nisu bili u filmovi jesu. Jer mislim da je samo to ispravno pitanje: Gdje su bili ovi momci? Ahsoka je izgledala kao da je važna, pa je li pozvana da se pridruži Sithima? Gdje je Rex? Osjetio sam da je na to trebao odgovor jer su bili, nakon toliko epizoda i priča, očigledno tako veliki dio Anakinovog i Obi-Wanovog života."
U jedanaestoj epizodi, pod nazivom "Shattered", Ahsoka pokušava dovesti Maula na Coruscant sa komandantom klonom po imenu Rex i bataljonom vojnika klonova. Pojavljuje se više veza na Osvetu Sita. Rekreirana je scena iz filma; u sceni, Mace Windu i Yoda raspravljaju o Palpatinu i njegovom smjenjivanju s dužnosti nakon poraza generala Grievousa s ostalim članovima Jedi vijeća. Scena je proširena sljedećom diskusijom sa Ahsokom.
Dok još putuju u svemir, Ahsoka i Maul obojica osjećaju pad Ahsokinog bivšeg gospodara. Pravi snimak dijaloga iz Osvete Sita sa Haydenom Christensenom, Samuelom L. Jacksonom i Ianom McDiarmidom kao njihovim likovima koji igraju preko scene.
Slijedeći Anakinov red, Sidious aktivira Red 66. Čipovi inhibitora su stavljeni u svaki vojnik klona. Kada je proglašena Naredba 66, prisiljeni su da ubiju svakog Jedaja protiv svoje volje. Nakon što je naredba data, Rex i njegovi klonovi napadaju Ahsoku.
Pobjeda i smrt
Sa Rexovom slobodom volje obnovljenom, njih dvoje pokušavaju pobjeći s krstarice Republike u finalu serije pod nazivom "Pobjeda i smrt". Ovo komplikuje Maul koji uništava brodski hiperpogon. Ovo čini kruzer prilično beskorisnim jer ga vuče gravitacija mjeseca.
Dok se krstarica kreće prema površini mjeseca, Maul bježi koristeći šatl vjerovatno do Spoljnog ruba gdje postaje poznat kao Grimizna zora kao što se vidi u Solo: Priča o Ratovima zvijezda.
Rex i Ahsoka koriste Y-Wing da bezbedno slete na površinu meseca dok se kruzer ruši ubijajući sve klonove na brodu. Njih dvoje sahranjuju svoje poginule drugove, a Ahsoka ostavlja svoju svetlosnu sablju na grobu.
Epizoda završava tako što bataljon jurišnih trupa istražuje mjesto nesreće koje je sada prekriveno snijegom. Darth Vader je s njima. Vader pronalazi Ahsokin svjetlosni mač; onaj koji joj je poklonio u "Old Friends Not Forgotten", devetoj epizodi poslednje sezone.
Filoni je za ABC News rekao: "Nadam se da fanovi odlaze sa jednog nivoa vrlo zadovoljni, i nadam se da će otići s većim razumijevanjem, posebno za Džedaje i silu i šta sve to znači u ovoj priči. Stvarno se radi o znakova na kraju."
Nakon ratova klonova
Ahsokina priča se nastavlja nakon serije. Roman Ahsoka, koji je napisao E. K. Johnston, prati Ahsokino putovanje godinu dana nakon Naredbe 66 i govori kako je upoznala Baila Organu, Lejinog usvojenog oca, i pridružila se pobuni.
Ahsoka se pojavljuje u prve dvije sezone Star Wars Rebels-a koja se odvija 14 godina nakon Ratova klonova kao agent pobunjenika. Tokom druge sezone, Ahsoka otkriva istinu da je njen bivši gospodar, Anakin Skywalker, Darth Vader. Njih dvoje se svađaju i Ahsokina sudbina je ostala dvosmislena. Međutim, u četvrtoj sezoni otkriveno je da je Ahsoku spasio Ezra, glavni lik serije. Ahsoka živi da vidi kraj carstva.
Ahsoka je imala kameju glasa u filmu Uspon Skajvokera i priča se da će se pojaviti u drugoj sezoni Mandalorijanca.
